Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms