Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX12Q9UMY4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms