Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms