Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHIC2Q9UKJ5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms