Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYTH4Q9UIA0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms