Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms