Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms