Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms