Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms