Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms