Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDHAF3Q9NRP4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDHAF3Q9NRP4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDHAF3Q9NRP4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDHAF3Q9NRP4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SDHAF3Q9NRP4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDHAF3Q9NRP4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDHAF3Q9NRP4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms