Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms