Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms