Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms