Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPEF2Q9C093 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPEF2Q9C093 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms