Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms