Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms