Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FYCO1Q9BQS8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms