Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms