Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms