Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms