Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP53Q96M91 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms