Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms