Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF1Q92879 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms