Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RABGGTAQ92696 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABGGTAQ92696 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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RABGGTAQ92696 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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RABGGTAQ92696 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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RABGGTAQ92696 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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