Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms