Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IL1Q8TBN0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms