Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms