Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms