Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms