Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2Q6XPS3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms