Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SAMD13Q5VXD3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SAMD13Q5VXD3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD13Q5VXD3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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