Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WASHC2DQ5SRD0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WASHC2DQ5SRD0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms