Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms