Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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