Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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