Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK3Q16288 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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