Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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