Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms