Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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