Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TCOF1Q13428 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27■■□□□ 1.91
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