Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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AP3B2Q13367 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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AP3B2Q13367 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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AP3B2Q13367 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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