Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF6Q13247 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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