Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME3Q13232 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NME3Q13232 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NME3Q13232 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME3Q13232 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME3Q13232 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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