Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms