Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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