Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms