Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms