Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYCNQ0VAF6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYCNQ0VAF6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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