Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN11Q06124 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms